Lightningの元のデータをカスタマイズしてもバージョンアップの際には全て新しいデータで上書きされてしまうので、カスタマイズの際には子テーマでのカスタマイズを推奨しています。
子テーマでカスタマイズしやすいサンプル用データは下記よりダウンロードできます。
ダウンロードしたzipファイルを解凍してお好みに応じて改変した上で、FTPなどでテーマと同様に
/wp-content/themes/ ディレクトリにアップしてご利用ください。
なお、WordPressサイトのデザインの微調整方法についてはこちらを参考にしてください。初心者向けに、HTMLとCSSの基本、Chromeのデベロッパーツールを使って変更箇所を調べる方法を説明しています。
Lightning Variety
Lightningをコンテンツマーケティングやメディアサイトとして活用するためにデザインと機能を強化したのが有料の拡張デザインスキン「Variety（ヴァラエティ）」です。